A Unifei – Campus de Itabira possui em funcionamento seis programas de pós-graduação:
Mestrado
Mestrado Profissional em Gestão e Regulação de Recursos Hídricos (ProfÁgua)
Mestrado Profissional em Engenharia de Materiais
Mestrado Profissional em Engenharia de Materiais
Doutorado
Doutorado em Ciência e Engenharia de Materiais
Atualmente, dois programas de pós-graduação possuem turmas exclusivas para o campus de Itabira: o Mestrado Profissional em Rede Nacional em Gestão e Regulação de Recursos Hídricos (ProfÁgua) e o Mestrado Profissional em Engenharia de Produção.
Os demais programas possuem origem em Itajubá, mas atualmente podem ser cursados também no Campus de Itabira.